As atividades de pesquisa na UNIGRANRIO fundamentam-se na inserção regional, por meio da identificação e do entendimento da situação nas áreas urbanas e rurais. Nessa identificação incluem-se os problemas, os conflitos e as potencialidades analisadas a partir dos aspectos técnicos e culturais da comunidade.

Nesse sentido, os Grupos de Pesquisa desenvolvem seus estudos com ênfase na tecnologia, na eco-eficiência e no desenvolvimento sustentável, sem abandonar os aspectos culturais, geográficos, socioeconômicos e éticos necessários à precisão e ao rigor científico.

Os Grupos de Pesquisa atualmente cadastrados na base de dados do CNPq e certificados pala UNIGRANRIO são:

Individualmente os professores são incentivados a elaborar projetos de pesquisa e, anualmente, fazer apresentações no Seminário de Pesquisa UNIGRANRIO.

O formulário de projeto da PROPEP permite a avaliação técnica da pesquisa por meio de apresentação, dentre outros, dos objetivos, da relevância, da metodologia, dos resultados esperados e do cronograma físico. O formulário de despesas permite, dentre outros, a apresentação dos custos com materiais, equipamentos e serviços de terceiros. Desta forma, a PROPEP mantem atualizada um cadastro das atividades de pesquisa em desenvolvimento na UNIGRANRIO. Além disso, nos Cursos de Pós-Graduação stricto sensu o coordenador, após aprovação do colegiado, envia os projetos de dissertação para cadastramento na PROPEP.

Ademais, a UNIGRANRIO, por meio do Programa Institucional de Iniciação Científica (PIIC) , proporciona ao aluno, orientado por pesquisador qualificado, a aprendizagem de técnicas e métodos de pesquisa, bem como estimula o desenvolvimento do pensar cientificamente e da criatividade, decorrentes das condições criadas pelo confronto direto com os problemas da pesquisa. A UNIGRANRIO, todos os anos, lança um Edital do PIIC com base no edital PIBIC do CNPq e promove um Seminário de Iniciação Científica  (SIC ).

Neste caso, aluno e orientador devem submeter o desenvolvimento de um programa de pesquisa por meio do formulário de projeto de iniciação científica . O mérito científico do projeto de pesquisa é inicialmente avaliado (formulário de avaliação ) pelo Comitê Institucional do PIIC e posteriormente julgado pelo Comitê Externo convidado pela PROPEP. Faz-se necessário notar que os alunos bolsistas do PIIC assumem o compromisso de apresentar os resultados da pesquisa no Seminário de Iniciação Científica da PROPEP/UNIGRANRIO com a presença do orientador, sempre que tiver pelo menos seis meses de bolsa.